月經週期的計算從月經來潮當日為第一天，計算至下次月經來潮前一天。
正常月經週期應介於21天至35天之間，過長或過短都可能影響受孕機率。
以28天的週期為例，可分為以下幾個階段：
●濾泡期：月經週期的第1-13天。腦下垂體分泌性腺刺激素，以促進卵巢中的濾泡成長。
每次週期初始，同時會有數個濾泡成長，最終挑選出最成熟的一個形成卵子。此時期的卵巢會分泌雌激素，作用於子宮使內膜逐漸增厚，孕育新生命所需的環境做準備。
●排卵期：月經週期的第14天，腦下垂體會在極短的時間內大量分泌黃體刺激素（LH），促使濾泡成熟產生排卵，剩餘的濾泡則形成黃體。
卵子排出後，約有24小時的時間可與精子結合，而精子在女性體內約可維持2-3天的壽命，因此最佳的受孕期約為排卵前3天至排卵後1日。
●黃體期：是月經週期的第15-28天。排卵後的濾泡形成黃體，可製造黃體素。使子宮內膜增生，提供胚胎發育的環境。若未受孕，黃體將逐漸萎縮失去功能，黃體素分泌下降使子宮內膜剝落，形成月經來潮。排卵後由於體內黃體素上升，會導致體溫上升攝氏0.5度左右，並持續到下一次月經來潮前。因此可利用基礎體溫的測量，判定月經週期的排卵日。
一般人在停經前10-15年時濾泡數目會急速減少，同時月經週期的天數也會改變。如果較二十幾歲的週期天數縮短3-4天，則可預見生殖能力已經逐漸降低。