彰基醫學中心為彰化、雲林、南投唯一醫學中心，也是急重難症照護後盾，自創立至今秉持不以營利為目的、關懷弱勢、持守基督信仰的營運模式；而體系營運中心即是在總院長陳穆寬教授領導下，以「正向、積極、效能、效率、精進」的原則實踐榮神益人的彰基營運精神。
◎運籌帷幄‧提升營運效能
體系營運中心組織編制包含總院科務績效中心、體系發展中心，以及體系分院副院長/處長，工作範疇乃是配合院方政策規劃彰基體系營運策略與方向，也協調體系總分院的營運發展、醫院擴充計畫等專案；導入各項策略規劃管理工具，並充分運用以達成體系整體目標及良好作業績效，在不以營利為目的的原則下，為醫院提升效能、妥善分配資源，將餘裕用於照護員工、關懷弱勢與偏鄉。
近年秉持「深根建造‧謙卑服事」的精神，整合院內各項資源協助規劃並推動執行深根在地、挹注醫療資源缺乏地區的專案，例如雲基醫院、南基醫院擴充案，以及與經濟部及工研院合作的「社區行動健檢」專案計畫、兩度籌畫前往離島馬祖進行義診等，將高品質醫療照護帶到偏鄉地區。另規劃以高科技智能規格打造癌症質子醫療大樓，使中南部民眾無須舟車勞頓北上就醫，也能享有最先進的癌症治療。
◎解析資訊‧協助智慧決策
為協助院方主管決策，體系營運中心蒐集分析國內外醫療環境資訊，包含醫療衛生政策、全民健保政策、業界同儕及流行病等資料，提供分析與建議，以協助擬定短、中、長程營運策略方向。
另外於單位內著手成立情資中心(戰情室)，以HIS系統資訊建置模組並製作動態視覺化管理儀表板，內含多維度分析資料庫，並統一指標定義及資料呈現，即時掌握並預測院內門診、急診、住院、手術等醫療業務狀況，以供各該部門主管即時因應與調整策略；定期檢討分析院內各項指標，協助科部善盡醫學中心使命與任務，達成醫療服務品質目標。
近期透過情資中心宏觀調控，疏通床位、減少壅塞，增加服務量能並減少候床時間；並透過分析民眾就醫需求，經總院長指示下加開掛號易額滿科別門診、夜間及週六門診，增設診間與調整門診區空間，以提升就醫便利性與可近性、減少民眾等待時間與精神耗費。未來亦回應民眾需求，於七期質子醫療大樓設計規畫多項整合照護中心，如女性整合醫療中心、消化系中心、胸腔及呼吸道中心等，整合檢查空間與診治檢驗，於同樓層同區更便利。
◎管理績效‧實踐榮神益人
自2019年底起，連續多年疫情海嘯侵襲，但是透過陳總院長的明快決策在經營上步步為營，專注醫療本業提升管理效率與醫療品質，使得本院醫療本業收支結餘排名於全台醫學中心名列前茅。盈餘部分秉持耶穌基督仁愛精神，以及企業永續發展的原則，一部分回饋辛苦的員工，於2023年春節發放3.1個月加一萬元的年終獎金，並設置全台醫學中心第一家非營利幼兒園，為員工及員工家庭打造安心幸福職場。
另外，體系營運中心在經營管理上講求「效率、效能」，在精神上則透過每日早晨的晨更時間以詩歌、經文分享，幫助同工們在工作之前整理心緒，能「正向、積極」應對每個受託的挑戰，在作業上「精進」管理能力，期盼能在院方主管的帶領下，於工作崗位中堅守主道、榮神益人。
神能將各樣的恩惠多多的加給你們，使你們凡事常常充足，能多行各樣善事。(哥林多後書9:8)
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2023年復活節全單位參加尋彩蛋活動。
處長 洪富一管理師