雲林基督教醫院創立於1999年8月8日，成立的初衷是為了填補雲林縣醫療資源的缺乏，本著回饋鄉梓的精神在一片綠油油的稻田中央設立社區型醫院，讓當地民眾不再需要南北奔波，能夠在地就醫，為當地民眾提供親切與優質的醫療服務。2009年3月1日，本院改制為隸屬【彰化基督教醫療財團法人】分院，將彰基醫學中心的醫療品質延續到雲林縣，並投入數億經費新建醫療大樓、放射腫瘤中心、手術室、護理之家等，在歷任院長及全體同工的努力和在地鄉親的支持下，本院已成為在地醫療照護的重要支柱。
回想起25年深耕社區，得到了在地民眾的認同，民眾常說「在這裡有醫院實在很方便」，這讓我們感到非常欣慰。秉持著鄉親、社會大眾對醫療政策的重視，本院對於在地鄉親的責任感，努力榮獲了許多獎項與肯定，包括WHO健康促進醫院認證、教學醫院、醫院評鑑、高齡友善醫院、緊急醫療能力分級評定中度級急救責任醫院、癌症篩檢績優醫院等，致力於提供優質的醫療服務：
本院具備下列數項醫療特色：
(一)寬敞舒適的醫療空間及醫療專業
2017年10月啟用雅各大樓，包含護理之家200床、醫學中心等級手術室8間、新建門診區、衛教中心、放射腫瘤中心、心導管室、檢查室等，提供全新寬敞醫療空間。目前總床數332床，包括急性一般病床200床、加護病房24床、手術室8間、血液透析床53床、呼吸照護病床30床。設有完善的中、西醫診療門診區，並提供24小時全天候急診醫療服務，包括內科、外科、骨科、外傷科緊急醫療診治及內、外、婦、兒次專科約30餘類醫療次專科門診服務。發展腫瘤醫學及提供民眾中西醫合併的整合醫療照護，如：中風病人、癌症、慢性病整合照護等。
(二)醫學中心等級的硬體設備
透過雲端智能導入醫療創新服務，引進數位式高解析血管X光攝影儀、3D螺旋電腦斷層攝影儀、1.5T核磁共振攝影儀(MRI)、醫療影像數位化系統 (PACS)、電腦斷層掃描機(CT)、新型腦部手術立體定位儀、數位乳房攝影儀(Digital Mammo)、雙向數位平版心導管儀、放射治療直線加速器等高科技醫療設備。
(三)深耕社區、整合社會資源
秉持著提昇社區整體健康的目標，整合社會資源持續推動社區民眾預防保健、健康促進，推展個人化精準醫療服務，加強慢性病管理與成人健康加值服務及癌症篩檢，守護社區民眾健康，並與社區診所合作，強化社區醫療群功能，成為社區好醫院，推展公共衛生四段七級，加強居家醫療、疾病末期安寧緩和照護及悲傷輔導，設置社區整體照顧體系A據點人力，每年執行長照2.0_失智共照中心、社區樂智據點、醫事C據點(巷弄長照站)之社區服務，提供連續性服務。另附設護理之家，為需要長期照護的患者提供專業服務。
面臨的挑戰與應變策略
在健保制度多變的環境下，我們仍能順利推展業務，這歸功於全體同工任勞任怨的精神，以及我們堅持初衷的信念及上帝的恩典。未來，我們將面臨更多政策與經營上的挑戰，包括老年化、少子化、通膨壓力、新興傳染病、節能永續、社會共融要求的影響等。在為應對這些挑戰，我們制定了以下策略：
1.積極投入加強全科化醫療，提供全面的醫療服務。
2.網羅優秀專科醫師，提升良好的醫療品質。
3.整合社會資源，推動社區健康促進服務。
4.配合衛生政策，推動垂直整合，如雙向轉診服務、醫療群合作。
5.強化醫療品管與醫務管理，提升醫療服務的運作效率。
6.發展雲林縣缺乏的眼科、心臟血管及腫瘤醫學服務，補足醫療資源的空缺。
未來展望
感謝上帝的揀選，相信在上帝的引領下，我們的醫療事工將更加完備，經營團隊擬定2025年策略主題：
•強化特色醫療，建構韌性照護團隊：我們將進一步提升特色醫療服務，培養專業的照護團隊，確保患者獲得最佳的醫療照護。
•整合社區資源，發展多元長照服務：結合社區資源，發展多元化的長期照護服務，滿足老年人口及慢性病患者的需求。
我們深知未來挑戰重重，但我們有信心在全體同工的共同努力下，繼續肩負北雲林緊急醫療急救責任醫院的重要使命，共同為社區居民促進健康、維護健康、恢復健康而用心和努力，實現本院願景【成為雲林民眾首選社區醫院】，期待未來為雲林縣的醫療發展做出更多的貢獻。
2024年雲基國際護師節感恩讚美禮拜
雲林基督教醫院院長 鄭清源醫師